学校由原舟山市职教中心、舟山市经贸学校、舟山市汽校、定海区农技学校四校合并而成，于1999年4月正式挂牌成立。

2000年6月被评为省一级重点职校，2002年7月被教育部、劳动与社会保障部、国家经贸委评为全国职业教育先进单位。2003年11月被评为首批国家级重点中等职校，2004年11月被省教育厅、发展改革委、经贸委、劳动和社会保障厅确定为浙江省首批先进制造业技能型人才培养培训示范基地，2007年被授予全国教育系统先进集体、国家级实训基地、全国班级先进集体、省综合性公共实训基地，2009年获得浙江省禁毒教育示范学校、浙江省创建学习型先进集体、浙江省中职学校30强、浙江省首批中等职业教育课程改革基地学校等荣誉称号。学校还是省教科研先进集体、省优秀农村预备劳动力培训基地、省级现代教育技术实验学校、省青年志愿服务杰出集体称号、舟山市首批教育现代化学校、通过ISO9001 国际质量管理体系认证。是舟山市规模最大、设备师资最优、项目最全的综合性中等职业技能培训基地。

2003年8月，舟山市教育局、舟山职业技术学校、浙江金鹰集团有限公司、浙江扬帆船舶集团有限公司、浙江弘生集团共同出资发起组建了职业教育联合体－－舟山职业教育集团，成为舟山市政府2003年百大实事工程之一。集团围绕国家级实训基地、省级综合性公共实训基地、省级先进制造业技能型人才培养培训示范基地、省优秀农村预备劳动力培训基地、省阳光工程培训基地、舟山市职业技能培训中心。集团以资产、专业建设、人才培养为纽带，实行校企紧密合作、资源共享，开展职业教育和技能培训，为企业培养适应现代企业发展的技术熟练的高素质员工。

2010年10月，浙江省人力资源和社会保障厅批准开办全日制省级重点技工学校-----舟山市技工学校。该校隶属于舟山市教育局和市人力资源和社会保障局共同管辖。学校在舟职技校部分专业的基础上通过整合中国水产舟山海洋渔业公司职业技术学校（简称“舟渔技校”）、中国人民解放军第4806工厂职业技术学校（简称“4806技校”）。该校与舟职技校实行合署办公。

2011年，为适应海洋经济发展要求，市政府整合舟山海洋渔业公司技校、海军4806工厂技校，成立舟山市技工学校，与舟山职业技术学校实行两块牌子、一套班子，共享办学资源。2012年学校通过省重点技工学校验评，2014年获批舟山技师学院（筹）。 [2]